En 1981, las Madres de la Asunción deciden subrogar la regencia de la institución a la Pontificia Universidad Católica del Ecuador, sede en Cuenca. En 1983, adquiere el carácter de EXPERIMENTAL. En octubre de 1988, el Colegio acoge a estudiantes de ambos sexos y se organiza como Unidad Educativa Mixta. En febrero de 1991 entra en vigencia el proyecto experimental denominado “Nueva estructura y orientación del nivel medio dentro del sistema educativo”; se mantiene el sistema de educación personalizada tanto en su filosofía como en su metodología, y se adopta la modalidad de quimestres. Asimismo, se implementan las “guías de curso” que reemplazan a los inspectores de curso y dirigentes.